محمدرضا مقدسیان طی ۳۳ سال فعالیت هنری خود بیش از ۳۵ فیلم مستند را کارگردانی و تهیه کرد که تعدادی از آن‌ها از ماندگارترین فیلم‌های مستند تاریخ سینمای ایران است.

سری فیلم‌های «کولی‌های ایران» نخستین کار پژوهشی او در سینمای مستند بود که با راهنمایی فریدون رهنما آغاز شد. «ملحمه آخر» (۱۳۵۲) نخستین فیلم مقدسیان در کسوت مستندساز است و «نگارگر الطافی»، «کوره‌پزخانه»، مجموعه‌ی «آب و آبیاری سنتی در ایران»، «سرود دشت نیمور»، «گفت‌وگو در مه» از دیگر آثار ماندگاری است که مقدسیان از خود به یادگار گذاشته است.

کسب چندین جایزه معتبر داخلی و خارجی ازجمله مقام نخست جشنواره‌ی مسکو (۱۹۸۱)، جایزه‌ی ویژه جشنواره‌ی اتحادیه فیلم‌سازان آسیا و اقیانوسیه (۱۹۸۷) و سیمرغ بلورین جشنواره فیلم فجر از افتخارات او در عرصه‌ی سینماست.

مقدسیان اولین کارگردانی بود که به پروژه «کارستان» دعوت و مشغول به کار شد. او مرحله‌ی پژوهش اولین فیلم از سری فیلم‌های مستند «کارستان» را آغاز کرده بود که بیماریِ ناگهانی‌ای نگذاشت تا پایان کار همراه آن باشد. او در خرداد ۱۳۹۴ دارفانی را وداع گفت.